系统工程研究院科研力量雄厚,是全军跨领域、跨学科、跨系统的综合性科研机构,科研力量布局涉及一级学科43个、二级学科80个,在军事装备学、军事后勤学、信息与通信工程、计算机科学与技术、电子科学与技术等学科方面,具有明显的特色优势。设立5个博士后科研工作站,建有武器装备体系研究和网络攻防技术等2个国防科技重点实验室,国家生物防护装备工程技术研究中心、全军通信靶场等7个国家和军队重点实验室及环境。

  研究院人才队伍强大,拥有一支以“两院院士”和国家级专家为引领、全军领军人才和拔尖人才为先锋、领域专家和青年人才为骨干的科研队伍。现有“两院院士”5人,国家有突出贡献中青年专家4人,全国优秀科技工作者8人,国家百千万人才工程人选8人,全军科技领军、学科拔尖人才及培养对象28名,“青年科技奖”4人,“求是奖”7人,“何梁何利”奖3人,“军队杰出专业人才奖”3人,“全国创新争先奖”1人,兼任国际高端学术团体及国家一级学会(协会)常务理事以上职务15人享受政府特殊津贴45人。

  研究院科研成果丰硕,先后获国家科技进步特等奖2项、国家科技进步一等奖14项、国家科技进步二等奖44项、军队科技进步一等奖194项、军队科技进步二等奖452项。取得国家和国防专利400余项,出版学术专著60余部、学科教材20余套。
  研究院学习、科研和生活条件优越,现有藏书10万余册,电子图书9万余册,建有国际互联网专线、局域网应用系统和电子期刊查询系统。